MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017796	TCC	2	6	39	44	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017796	AATTT	2	10	45	54	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017796	CAA	2	6	99	104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017796	ATTA	2	8	145	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017796	CT	3	6	153	158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017796	TCT	2	6	176	181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017796	TTGT	2	8	218	225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017796	T	6	6	241	246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017796	T	6	6	270	275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017796	AGA	2	6	292	297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017796	AAT	2	6	302	307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017796	TTA	2	6	320	325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017796	TCA	2	6	326	331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017796	TTA	3	9	344	352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017796	TCC	2	6	404	409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017796	CAT	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017796	TTA	2	6	498	503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017796	T	7	7	523	529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017796	TTA	2	6	539	544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017796	TCT	2	6	551	556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017796	T	7	7	556	562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017796	TCA	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017796	ATT	2	6	580	585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017796	ACA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017796	A	6	6	599	604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017796	TAT	2	6	621	626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017796	AAT	2	6	629	634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017796	TAA	2	6	670	675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017796	TAAA	2	8	678	685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017796	T	6	6	686	691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017796	CTT	2	6	707	712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017796	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017796	N	142	142	734	875	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017796	ATT	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017796	TTA	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017796	A	6	6	910	915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017796	ATT	2	6	945	950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017796	T	6	6	953	958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017796	ACT	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017796	AT	3	6	994	999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017796	TAT	2	6	1006	1011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017796	TTA	2	6	1136	1141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017796	T	6	6	1186	1191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017796	A	7	7	1194	1200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017796	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	386858761
46	NC_017796	A	6	6	1252	1257	100 %	0 %	0 %	0 %	386858761
47	NC_017796	TTAT	2	8	1258	1265	25 %	75 %	0 %	0 %	386858761
48	NC_017796	TA	3	6	1271	1276	50 %	50 %	0 %	0 %	386858761
49	NC_017796	TA	3	6	1292	1297	50 %	50 %	0 %	0 %	386858761
50	NC_017796	T	6	6	1351	1356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017796	AT	3	6	1366	1371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017796	TTA	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017796	TA	4	8	1456	1463	50 %	50 %	0 %	0 %	386858762
54	NC_017796	TC	3	6	1485	1490	0 %	50 %	0 %	50 %	386858762
55	NC_017796	GAGG	2	8	1501	1508	25 %	0 %	75 %	0 %	386858762
56	NC_017796	TGTT	2	8	1514	1521	0 %	75 %	25 %	0 %	386858762
57	NC_017796	ATG	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858762
58	NC_017796	TGAT	2	8	1535	1542	25 %	50 %	25 %	0 %	386858762
59	NC_017796	AT	3	6	1598	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	386858762
60	NC_017796	TTTA	2	8	1606	1613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017796	ATA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017796	GAG	2	6	1689	1694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017796	TAG	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858763
64	NC_017796	AGT	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858763
65	NC_017796	TCTTA	2	10	1816	1825	20 %	60 %	0 %	20 %	386858763
66	NC_017796	TACT	2	8	1836	1843	25 %	50 %	0 %	25 %	386858763
67	NC_017796	ATTAA	2	10	1856	1865	60 %	40 %	0 %	0 %	386858763
68	NC_017796	ATT	2	6	1924	1929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858763
69	NC_017796	CTA	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858763
70	NC_017796	ACC	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858763
71	NC_017796	CAT	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858763
72	NC_017796	T	6	6	2096	2101	0 %	100 %	0 %	0 %	386858763
73	NC_017796	ATCA	2	8	2107	2114	50 %	25 %	0 %	25 %	386858763
74	NC_017796	CCT	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858763
75	NC_017796	AGCT	2	8	2146	2153	25 %	25 %	25 %	25 %	386858763
76	NC_017796	AGC	4	12	2167	2178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
77	NC_017796	CAG	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
78	NC_017796	CAG	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
79	NC_017796	CAG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
80	NC_017796	GCA	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
81	NC_017796	CAG	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
82	NC_017796	TCACT	2	10	2418	2427	20 %	40 %	0 %	40 %	386858763
83	NC_017796	TAA	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858763
84	NC_017796	ATTTA	2	10	2500	2509	40 %	60 %	0 %	0 %	386858763
85	NC_017796	CAA	2	6	2628	2633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858764
86	NC_017796	A	6	6	2675	2680	100 %	0 %	0 %	0 %	386858764
87	NC_017796	T	6	6	2718	2723	0 %	100 %	0 %	0 %	386858764
88	NC_017796	TAT	2	6	2731	2736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858764
89	NC_017796	CAG	3	9	2740	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
90	NC_017796	T	6	6	2849	2854	0 %	100 %	0 %	0 %	386858764
91	NC_017796	CAC	2	6	2878	2883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858764
92	NC_017796	CTT	2	6	2921	2926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858764
93	NC_017796	AGC	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
94	NC_017796	AAC	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858764
95	NC_017796	CAG	3	9	2983	2991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
96	NC_017796	ATC	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858764
97	NC_017796	CAT	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858764
98	NC_017796	CTT	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858764
99	NC_017796	CTA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017796	CTA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
101	NC_017796	CAA	2	6	3109	3114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858765
102	NC_017796	ATC	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
103	NC_017796	C	6	6	3193	3198	0 %	0 %	0 %	100 %	386858765
104	NC_017796	TAT	2	6	3199	3204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858765
105	NC_017796	TTCTT	2	10	3266	3275	0 %	80 %	0 %	20 %	386858765
106	NC_017796	ATC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
107	NC_017796	TTA	2	6	3296	3301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858765
108	NC_017796	ATG	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858765
109	NC_017796	CCA	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858765
110	NC_017796	TC	3	6	3474	3479	0 %	50 %	0 %	50 %	386858765
111	NC_017796	TCC	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858765
112	NC_017796	CTC	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858765
113	NC_017796	CAC	4	12	3520	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858765
114	NC_017796	CAT	3	9	3532	3540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
115	NC_017796	ATC	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
116	NC_017796	ATC	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
117	NC_017796	TC	3	6	3570	3575	0 %	50 %	0 %	50 %	386858765
118	NC_017796	TTC	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858765
119	NC_017796	N	1395	1395	3618	5012	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017796	A	6	6	5014	5019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017796	TTA	2	6	5030	5035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017796	ATA	2	6	5104	5109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017796	AATT	2	8	5111	5118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017796	AT	4	8	5129	5136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017796	AC	3	6	5144	5149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017796	ATAAA	2	10	5151	5160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017796	T	6	6	5215	5220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017796	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017796	TATT	2	8	5245	5252	25 %	75 %	0 %	0 %	386858766
130	NC_017796	TAC	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
131	NC_017796	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
132	NC_017796	TTAATT	2	12	5302	5313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858766
133	NC_017796	CTT	2	6	5315	5320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858766
134	NC_017796	TCA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
135	NC_017796	ATT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858766
136	NC_017796	CTG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858766
137	NC_017796	GCA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
138	NC_017796	CAT	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
139	NC_017796	GCA	2	6	5437	5442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
140	NC_017796	CTC	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858766
141	NC_017796	TTG	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858766
142	NC_017796	CAC	2	6	5558	5563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858766
143	NC_017796	TGC	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858766
144	NC_017796	T	7	7	5637	5643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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